大明万历年间，泉州港作为海上丝绸之路的重要枢纽，每日商船往来如织，桅杆林立。城中最负盛名的 “万帆船坊”，专为富商巨贾打造坚固精巧的海船，其精湛的造船技艺远近闻名。然而，看似繁荣的船坊背后，却隐藏着一个不为人知的秘密。

一日，船坊的老木匠陈阿海在修理一艘商船的罗盘时，发现罗盘底部竟刻着一些奇怪的符号。这些符号弯弯曲曲，既不像文字，也不像普通的图案，倒像是某种神秘的标记。陈阿海心中起疑，便将此事告知了船坊掌柜周明德。周明德接过罗盘，仔细端详了许久，脸色突然变得煞白，他支支吾吾地让陈阿海不要声张，此事他自会处理。

陈阿海虽觉得奇怪，但也不敢多问。可没过几日，陈阿海竟离奇失踪了。他的家人焦急万分，四处寻找无果后，只好报官。泉州知府命捕头林正调查此案。林正来到万帆船坊，询问周明德关于陈阿海失踪一事，周明德却称自己毫不知情，只说陈阿海可能是家中有事，突然离开了。

林正并未轻信周明德的话，他在船坊内仔细搜查，终于在一处废弃的工坊里，找到了那枚罗盘。林正看着罗盘上的奇怪符号，直觉告诉他，这与陈阿海的失踪有着密切的联系。他找来城中的学者和精通各类符号的能人，却无人能解读这些符号的含义。

就在案件陷入僵局时，林正从一位老渔民口中得知，多年前，泉州海域曾有一伙凶残的海盗，他们有一套独特的密码，用来传递消息和标记藏宝地点。林正心中一动，难道这罗盘上的符号就是海盗密码？

为了验证这个猜测，林正开始暗中调查周明德的过往。他发现，周明德早年曾出海经商，有一段时间行踪十分神秘，没有人知道他去了哪里。而且，近期船坊接待了几位形迹可疑的客人，他们总是在深夜与周明德密谈。

林正决定跟踪这些可疑之人。在一个月黑风高的夜晚，他发现这些人悄悄来到海边，登上一艘小船，朝着深海驶去。林正带着手下，驾船远远地跟在后面。经过几个时辰的航行，他们来到一座荒岛上。岛上一片漆黑，隐隐传来阵阵低语声。

林正等人小心翼翼地靠近，借着月光，他们看到岛上有一群人正在挖掘什么。突然，一声惊呼传来：“找到了！就是这个！” 林正定睛一看，那些人手中拿着的，竟是一箱箱金银财宝。而在财宝旁边，还摆放着几个刻有与罗盘上相同符号的木箱。

林正一声令下，捕快们一拥而上，将这群人团团围住。经过审讯，这群人正是当年那伙海盗的残余势力，而周明德竟是他们在陆地上的内应。原来，当年海盗们将一部分财宝藏在荒岛上，用独特的密码标记。如今，他们与周明德勾结，企图利用船坊的便利，重新取出财宝。而陈阿海发现罗盘上的密码后，周明德担心事情败露，便将他杀害。

真相大白后，周明德和海盗们受到了应有的惩罚，那批失踪已久的财宝也被充公。而那枚暗藏海盗密码的罗盘，成为了这段秘闻谜案的见证，也让人们不禁感叹，在这繁华的港口背后，竟藏着如此惊心动魄的故事。